6 мая 1992 г. Советом Министров Республики Карелия было принято постановление о создании республиканского Центра национальных культур. Предложение о создании Центра поступило от Комитета по национальной политике и межнациональным отношениям и Министерства Культуры РК, основывалось на инициативе национально-культурных общественных организаций карелов, вепсов и финнов-ингерманландцев . Цель создания Центра — содействие развитию традиционных культур и языков народов, проживающих на территории Карелии, а приоритетная задача — сохранение самобытной культуры и языков коренных малочисленных народов Карелии. Основными направлениями деятельности Центра стали разработка и реализация международных, межрегиональных и республиканских этнокультурных проектов, проведение курсов по традиционным ремеслам, языкам, оказание методической и организационной помощи национальным общественным организациям, разработка и осуществление культурных проектов и др. Для размещения Центру было передано на правах аренды здание-памятник по адресу ул. Кирова, 13-а в г. Петрозаводске (Дом ремесел). Официальное открытие состоялось 21 октября 1992 г.

В 2009 г. Центр национальных культур объединили с Карельским центром народного творчества, основанным еще в 1937 как Центральный Дом культуры. В 2018 г. учреждение реорганизовано в форме присоединения к нему АУ РК «»Центр культуры «Премьер».  

В настоящее время организация носит наименование ГАУ РК «Центр народного творчества и культурных инициатив Республики Карелия».  

На базе Центра действуют самодеятельные творческие коллективы, представляющие культуру финно-угорских, славянских, закавказских и многих других национальностей, проживающих в Карелии. Среди творческих коллективов Центра: Ингерманландский академический хор «Inkeri», Карельский народный хор «Oma pajo», Вепсский народный хор, мужской вокальный ансамбль «Роспев», Карельский народный театр «Ящерка», ансамбль казачьей песни «Алатырь», театр народной песни «Карусель»и многие другие яркие коллективы. При центре действуют курсы карельского языка, разговорный клуб «Вепсские беседы». Центр - организатор и партнер проектов Культурный марафон «Калевальская мозаика», «Дни славянской письменности и культуры», «Национальная палитра Карелии»  и др.